Το σπήλαιο του Αγίου Ιωάννη του Ερημίτη βρίσκεται στον δήμο Κολυμπαρίου, κοντά στη σημερινή Μαραθοκεφάλα της Σπηλιάς και μερικές εκατοντάδες μέτρα μακρύτερα από την Αρκουδοσπηλιά. Είναι και αυτό παλαιά κοίτη ποταμού με συνολικό μήκος περίπου 135 μέτρων σε μορφή οριζόντιας γαλαρίας. Έχει πλούσιο διάκοσμο σε πολλά σημεία με μεγάλους σταλακτίτες και σταλαγμίτες. Τόσο στην αρχή όσο και στο τέλος του σπηλαίου, υπάρχουν εικονίσματα και καντήλια. Υπάρχει επίσης στην αρχή του, λαξευτή υπόγεια δεξαμενή με επίχρισμα (κουρασάνι) για τη συλλογή νερού. Στα δεξιά της γαλαρίας, στα 15 μέτρα από την είσοδο, υπάρχει ένας μικρός θάλαμος με τεχνητά ανοιγμένη είσοδο και μέσα βρίσκονται κάποια ανθρώπινα οστά, πιθανότατα κάποιου ασκητή που έζησε μέσα στο σπήλαιο. Στο τέλος του σπηλαίου, στα 135 μέτρα, υπάρχει μια αρκετά μεγάλη λιθωματική λεκάνη (γκούρ) όπου ο θρύλος λέει ότι ήταν ο τάφος του Αγ. Ιωάννη του Ερημίτη. Η ιστορία αναφέρει ότι ο Άγιος Ιωάννης ο Ερημίτης ασκήτευε στην περιοχή, ζώντας γυμνός και περιφερόμενος σαν το αγρίμι μέσα στα βράχια. Ένας κυνηγός τον χτύπησε κατά λάθος, περνώντας τον για κάποιο ζώο, και εκείνος λίγο πριν πεθάνει χτυπημένος, ζήτησε από τον κυνηγό να τον μεταφέρει μέσα στο σπήλαιο για να πεθάνει