Η λίμνη της Αγιάς βρίσκεται αρκετά κοντά στην πόλη των Χανίων και αποτελείται από 450 στρέμματα προστατευόμενης έκτασης.Η περιοχή είναι επίσης ένας υδροβιότοπος όπου ζει ένα σπάνιο είδος βατράχου που βρίσκεται υπό εξαφάνιση. Τα τελευταία χρόνια πολλά αρδευτικά έργα για την ύδρευση της πόλης έχουν μειώσει δραματικά το μέγεθος της λίμνης και έχει βαλτοποιηθεί σε πολλά σημεία.